Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zbed3Q9D0L1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zbed3Q9D0L1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zbed3Q9D0L1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zbed3Q9D0L1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zbed3Q9D0L1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zbed3Q9D0L1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zbed3Q9D0L1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zbed3Q9D0L1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zbed3Q9D0L1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms