Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl55Q9CZ83 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl55Q9CZ83 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl55Q9CZ83 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms