Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXS4

Cenpv, Centromere protein V, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpvQ9CXS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpvQ9CXS4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CenpvQ9CXS4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpvQ9CXS4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CenpvQ9CXS4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpvQ9CXS4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms