Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms