Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ist1Q9CX00 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ist1Q9CX00 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ist1Q9CX00 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ist1Q9CX00 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ist1Q9CX00 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ist1Q9CX00 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms