Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Malsu1Q9CWV0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Malsu1Q9CWV0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Malsu1Q9CWV0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms