Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR78

Msantd3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd3Q9CR78 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msantd3Q9CR78 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Msantd3Q9CR78 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msantd3Q9CR78 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msantd3Q9CR78 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msantd3Q9CR78 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msantd3Q9CR78 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msantd3Q9CR78 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms