Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQM1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQM1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQM1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQM1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQM1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQM1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CQM1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CQM1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQM1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQM1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CQM1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQM1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQM1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQM1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQM1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CQM1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQM1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms