Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl20Q9CQL4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl20Q9CQL4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl20Q9CQL4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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