Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ5

Prr13, Proline-rich protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr13Q9CQJ5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr13Q9CQJ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr13Q9CQJ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr13Q9CQJ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prr13Q9CQJ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms