Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Tmed6Q9CQG0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Tmed6Q9CQG0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18,16■□□□□ 0,5
Tmed6Q9CQG0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Tmed6Q9CQG0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18,15■□□□□ 0,5
Tmed6Q9CQG0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Tmed6Q9CQG0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,5
Tmed6Q9CQG0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,5
Tmed6Q9CQG0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18,11■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,11■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Tmed6Q9CQG0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18,06■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18,03■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Tmed6Q9CQG0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18,02■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17,99■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Tmed6Q9CQG0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17,95■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,95■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Tmed6Q9CQG0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms