Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Rnf17Q99MV7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rnf17Q99MV7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Rnf17Q99MV7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rnf17Q99MV7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rnf17Q99MV7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rnf17Q99MV7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rnf17Q99MV7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rnf17Q99MV7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms