Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmp1Q99KU0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmp1Q99KU0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmp1Q99KU0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmp1Q99KU0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmp1Q99KU0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmp1Q99KU0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmp1Q99KU0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmp1Q99KU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmp1Q99KU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmp1Q99KU0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmp1Q99KU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmp1Q99KU0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmp1Q99KU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms