Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rnf34Q99KR6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rnf34Q99KR6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rnf34Q99KR6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rnf34Q99KR6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Rnf34Q99KR6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rnf34Q99KR6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rnf34Q99KR6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,7 ms