Protein–RNA interactions for Protein: Q99J93

Ifitm2, Interferon-induced transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm2Q99J93 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifitm2Q99J93 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifitm2Q99J93 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifitm2Q99J93 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm2Q99J93 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms