Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Basp1Q91XV3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Basp1Q91XV3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Basp1Q91XV3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Basp1Q91XV3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Basp1Q91XV3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Basp1Q91XV3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Basp1Q91XV3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms