Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ6

Sgsm3, Small G protein signaling modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm3Q8VCZ6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sgsm3Q8VCZ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgsm3Q8VCZ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sgsm3Q8VCZ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgsm3Q8VCZ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgsm3Q8VCZ6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgsm3Q8VCZ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgsm3Q8VCZ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgsm3Q8VCZ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgsm3Q8VCZ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgsm3Q8VCZ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgsm3Q8VCZ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgsm3Q8VCZ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgsm3Q8VCZ6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms