Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh10Q8VCH7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh10Q8VCH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh10Q8VCH7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh10Q8VCH7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh10Q8VCH7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh10Q8VCH7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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