Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BbxQ8VBW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BbxQ8VBW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BbxQ8VBW5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BbxQ8VBW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BbxQ8VBW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BbxQ8VBW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms