Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11fip5Q8R361 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab11fip5Q8R361 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip5Q8R361 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms