Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D6

Vmn1r24, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r24Q8R2D6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r24Q8R2D6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r24Q8R2D6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r24Q8R2D6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r24Q8R2D6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r24Q8R2D6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r24Q8R2D6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r24Q8R2D6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r24Q8R2D6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r24Q8R2D6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r24Q8R2D6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r24Q8R2D6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r24Q8R2D6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r24Q8R2D6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r24Q8R2D6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r24Q8R2D6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r24Q8R2D6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms