Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MyripQ8K3I4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MyripQ8K3I4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MyripQ8K3I4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.58■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MyripQ8K3I4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MyripQ8K3I4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MyripQ8K3I4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MyripQ8K3I4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MyripQ8K3I4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MyripQ8K3I4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.3 ms