Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FntbQ8K2I1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FntbQ8K2I1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FntbQ8K2I1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FntbQ8K2I1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FntbQ8K2I1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FntbQ8K2I1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms