Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gin1Q8K259 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gin1Q8K259 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gin1Q8K259 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gin1Q8K259 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gin1Q8K259 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms