Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pnpt1Q8K1R3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pnpt1Q8K1R3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pnpt1Q8K1R3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pnpt1Q8K1R3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnpt1Q8K1R3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpt1Q8K1R3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pnpt1Q8K1R3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pnpt1Q8K1R3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pnpt1Q8K1R3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnpt1Q8K1R3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms