Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Afg3l2Q8JZQ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Afg3l2Q8JZQ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Afg3l2Q8JZQ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Afg3l2Q8JZQ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Afg3l2Q8JZQ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Afg3l2Q8JZQ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Afg3l2Q8JZQ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Afg3l2Q8JZQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms