Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Podxl2Q8CAE9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Podxl2Q8CAE9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Podxl2Q8CAE9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Podxl2Q8CAE9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Podxl2Q8CAE9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Podxl2Q8CAE9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Podxl2Q8CAE9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Podxl2Q8CAE9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Podxl2Q8CAE9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Podxl2Q8CAE9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Podxl2Q8CAE9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Podxl2Q8CAE9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Podxl2Q8CAE9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Podxl2Q8CAE9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms