Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RtknQ8C6B2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RtknQ8C6B2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RtknQ8C6B2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RtknQ8C6B2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtknQ8C6B2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtknQ8C6B2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RtknQ8C6B2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RtknQ8C6B2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RtknQ8C6B2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RtknQ8C6B2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RtknQ8C6B2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtknQ8C6B2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RtknQ8C6B2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RtknQ8C6B2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms