Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Lrsam1Q80ZI6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Lrsam1Q80ZI6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Lrsam1Q80ZI6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Lrsam1Q80ZI6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Lrsam1Q80ZI6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Lrsam1Q80ZI6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lrsam1Q80ZI6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lrsam1Q80ZI6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Lrsam1Q80ZI6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Lrsam1Q80ZI6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Lrsam1Q80ZI6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Lrsam1Q80ZI6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Lrsam1Q80ZI6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Lrsam1Q80ZI6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Lrsam1Q80ZI6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Lrsam1Q80ZI6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,7 ms