Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR3

Skida1, SKI/DACH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skida1Q80YR3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skida1Q80YR3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skida1Q80YR3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skida1Q80YR3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skida1Q80YR3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skida1Q80YR3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skida1Q80YR3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skida1Q80YR3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skida1Q80YR3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skida1Q80YR3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skida1Q80YR3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skida1Q80YR3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms