Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srrm3Q80WV7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm3Q80WV7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Srrm3Q80WV7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srrm3Q80WV7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srrm3Q80WV7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srrm3Q80WV7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms