Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcsk9Q80W65 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcsk9Q80W65 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcsk9Q80W65 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcsk9Q80W65 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk9Q80W65 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcsk9Q80W65 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcsk9Q80W65 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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