Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stambpl1Q76N33 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stambpl1Q76N33 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Stambpl1Q76N33 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stambpl1Q76N33 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stambpl1Q76N33 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stambpl1Q76N33 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stambpl1Q76N33 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms