Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Sned1Q70E20 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30,39■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Sned1Q70E20 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Sned1Q70E20 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Sned1Q70E20 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Sned1Q70E20 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sned1Q70E20 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,4
Sned1Q70E20 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Sned1Q70E20 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29,95■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms