Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Ncapd3Q6ZQK0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Ncapd3Q6ZQK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37,17■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Ncapd3Q6ZQK0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37,11■■■■□ 3,53
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Ncapd3Q6ZQK0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37,07■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37,06■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37,05■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37,01■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Ncapd3Q6ZQK0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3,51
Ncapd3Q6ZQK0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Ncapd3Q6ZQK0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Ncapd3Q6ZQK0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Ncapd3Q6ZQK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36,97■■■■□ 3,51
Ncapd3Q6ZQK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,89■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,89■■■■□ 3,5
Ncapd3Q6ZQK0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Ncapd3Q6ZQK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Ncapd3Q6ZQK0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36,86■■■■□ 3,49
Ncapd3Q6ZQK0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Ncapd3Q6ZQK0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Ncapd3Q6ZQK0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Ncapd3Q6ZQK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36,82■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36,8■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36,8■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36,76■■■■□ 3,48
Ncapd3Q6ZQK0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36,71■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Ncapd3Q6ZQK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36,69■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36,66■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,63■■■■□ 3,46
Ncapd3Q6ZQK0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36,63■■■■□ 3,45
Ncapd3Q6ZQK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Ncapd3Q6ZQK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Ncapd3Q6ZQK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,6■■■■□ 3,45
Ncapd3Q6ZQK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms