Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M2Q6W9L1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M2Q6W9L1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-M2Q6W9L1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms