Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfap2eQ6VUP9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tfap2eQ6VUP9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2eQ6VUP9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms