Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJN8

Dalrd3, DALR anticodon-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dalrd3Q6PJN8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dalrd3Q6PJN8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Dalrd3Q6PJN8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dalrd3Q6PJN8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Dalrd3Q6PJN8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dalrd3Q6PJN8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dalrd3Q6PJN8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dalrd3Q6PJN8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dalrd3Q6PJN8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dalrd3Q6PJN8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dalrd3Q6PJN8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dalrd3Q6PJN8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dalrd3Q6PJN8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dalrd3Q6PJN8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dalrd3Q6PJN8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Dalrd3Q6PJN8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dalrd3Q6PJN8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms