Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GmipQ6PGG2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GmipQ6PGG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GmipQ6PGG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GmipQ6PGG2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GmipQ6PGG2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GmipQ6PGG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GmipQ6PGG2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms