Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SvoplQ6PDF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SvoplQ6PDF3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SvoplQ6PDF3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SvoplQ6PDF3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SvoplQ6PDF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms