Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Trak1Q6PD31 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Trak1Q6PD31 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Trak1Q6PD31 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Trak1Q6PD31 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Trak1Q6PD31 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Trak1Q6PD31 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Trak1Q6PD31 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Trak1Q6PD31 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Trak1Q6PD31 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Trak1Q6PD31 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35,02■■■■□ 3,2
Trak1Q6PD31 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Trak1Q6PD31 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Trak1Q6PD31 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Trak1Q6PD31 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Trak1Q6PD31 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Trak1Q6PD31 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Trak1Q6PD31 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Trak1Q6PD31 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Trak1Q6PD31 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Trak1Q6PD31 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34,82■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
Trak1Q6PD31 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Trak1Q6PD31 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Trak1Q6PD31 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Trak1Q6PD31 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Trak1Q6PD31 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Trak1Q6PD31 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Trak1Q6PD31 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Trak1Q6PD31 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Trak1Q6PD31 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Trak1Q6PD31 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Trak1Q6PD31 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34,54■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Trak1Q6PD31 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms