Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PrimpolQ6P1E7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PrimpolQ6P1E7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PrimpolQ6P1E7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrimpolQ6P1E7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PrimpolQ6P1E7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PrimpolQ6P1E7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PrimpolQ6P1E7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PrimpolQ6P1E7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PrimpolQ6P1E7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PrimpolQ6P1E7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PrimpolQ6P1E7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PrimpolQ6P1E7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PrimpolQ6P1E7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PrimpolQ6P1E7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms