Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Pprc1Q6NZN1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Pprc1Q6NZN1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Pprc1Q6NZN1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Pprc1Q6NZN1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Pprc1Q6NZN1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Pprc1Q6NZN1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Pprc1Q6NZN1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Pprc1Q6NZN1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pprc1Q6NZN1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pprc1Q6NZN1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Pprc1Q6NZN1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Pprc1Q6NZN1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pprc1Q6NZN1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pprc1Q6NZN1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Pprc1Q6NZN1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Pprc1Q6NZN1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Pprc1Q6NZN1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Pprc1Q6NZN1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Pprc1Q6NZN1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Pprc1Q6NZN1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Pprc1Q6NZN1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Pprc1Q6NZN1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Pprc1Q6NZN1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Pprc1Q6NZN1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Pprc1Q6NZN1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pprc1Q6NZN1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Pprc1Q6NZN1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Pprc1Q6NZN1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Pprc1Q6NZN1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Pprc1Q6NZN1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Pprc1Q6NZN1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Pprc1Q6NZN1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Pprc1Q6NZN1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Pprc1Q6NZN1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Pprc1Q6NZN1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Pprc1Q6NZN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Pprc1Q6NZN1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms