Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpm4Q6IRU2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm4Q6IRU2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpm4Q6IRU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpm4Q6IRU2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpm4Q6IRU2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms