Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp1Q6A037 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
N4bp1Q6A037 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
N4bp1Q6A037 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4bp1Q6A037 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4bp1Q6A037 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
N4bp1Q6A037 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms