Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp4aQ64436 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp4aQ64436 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp4aQ64436 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp4aQ64436 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp4aQ64436 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp4aQ64436 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms