Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpegQ62407 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SpegQ62407 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpegQ62407 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpegQ62407 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms