Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Kdm5dQ62240 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.12
Kdm5dQ62240 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Kdm5dQ62240 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Kdm5dQ62240 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
Kdm5dQ62240 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
Kdm5dQ62240 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Kdm5dQ62240 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
Kdm5dQ62240 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Kdm5dQ62240 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Kdm5dQ62240 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC46.91■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC46.89■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
Kdm5dQ62240 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.09
Kdm5dQ62240 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Kdm5dQ62240 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
Kdm5dQ62240 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Kdm5dQ62240 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
Kdm5dQ62240 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Kdm5dQ62240 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Kdm5dQ62240 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Kdm5dQ62240 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Kdm5dQ62240 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Kdm5dQ62240 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Kdm5dQ62240 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Kdm5dQ62240 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
Kdm5dQ62240 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC46.73■■■■■ 5.07
Kdm5dQ62240 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
Kdm5dQ62240 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Kdm5dQ62240 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.07
Kdm5dQ62240 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC46.69■■■■■ 5.07
Kdm5dQ62240 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
Kdm5dQ62240 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
Kdm5dQ62240 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
Kdm5dQ62240 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
Kdm5dQ62240 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
Kdm5dQ62240 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Kdm5dQ62240 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Kdm5dQ62240 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Kdm5dQ62240 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.06
Kdm5dQ62240 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
Kdm5dQ62240 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Kdm5dQ62240 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
Kdm5dQ62240 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC46.47■■■■■ 5.03
Kdm5dQ62240 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Kdm5dQ62240 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC46.44■■■■■ 5.02
Kdm5dQ62240 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Kdm5dQ62240 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Kdm5dQ62240 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Kdm5dQ62240 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Kdm5dQ62240 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Kdm5dQ62240 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Kdm5dQ62240 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
Kdm5dQ62240 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
Kdm5dQ62240 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.01
Kdm5dQ62240 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
Kdm5dQ62240 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Kdm5dQ62240 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Kdm5dQ62240 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
Kdm5dQ62240 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC46.31■■■■■ 5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms