Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prm3Q62100 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prm3Q62100 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prm3Q62100 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prm3Q62100 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prm3Q62100 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prm3Q62100 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prm3Q62100 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prm3Q62100 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms