Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtrxQ61687 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtrxQ61687 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtrxQ61687 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AtrxQ61687 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AtrxQ61687 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms